Cette minuscule planète, situé dans la Bordure Extérieure, était un monde ardent, où la lave était extraite comme ressource minérale précieuse. Son paysage n´était que désolation, rempli à perte de vue de volcans déchiquetés, au sommet desquels de très hautes fontaines de feu et de la lave jaillissaient, soufflant tout sur la surface. Cette lave ensanglantaient le paysage par les coulées qui aboutissaient en fleuves de laves énormes. Le ciel de Mustafar était obscurcie par des nuages noirs de cendre, de la fumée et du tephra. L´activité géologique intense créa une interférence de balayage normal, qui permit de ne pas attirer les regards sur Mustafar durant une bonne partie de son histoire.


Decouverte par le Techno-Syndicat, les conditions inhospitalières firent de Mustafar une cachette idéale pour le Conseil Séparatiste, qui,à partir de cette planète, menaient leurs troupes vers la fin de la Guerre des Clones. C´est Dark Sidious, lui-même qui ordonna au Général Grievous d´envoyer le conseil séparatiste sur Mustafar, là où ils recevraient des instructions complémentaires. Un complexe industriel construit sur une falaise surplombant la lave servit de bunker au Conseil. Les soldats Neimoidiens et l´infanterie de droid de combat étaient chargés de la sécurité. Des boucliers déflecteurs servaient à protéger le complexe de l´environnement hostile.

Juste après son acention en temps qu´Empereur, Dark Sidious n´eut plus besoin des Séparatistes. Il expédia son nouvel apprenti, Dark Vador, pour se débarasser d´eux.
A son arrivée, Vador parcouru silencieusement le corridor d´entrée, et tua de sa lame les membres du Conseil, un par un, ainsi que les gardes postés là. Il mit fin, ainsi, à la Guerre des Clones.

C´est sur cette planète apocalyptique qu´Obi-Wan Kenobi afronta son ancien apprenti, Dark Vador, dans un duel spectaculaire. Au cours de ce duel, les boucliers fûrent mis hors d´usage, ce qui exposa le complexe à la fureur géologique de la planète.

Un geyser de lave éclata, retombant sur le bras métallique où le duel continuait entre le maître Jedi et l´apprenti Sith. Le poids et la chaleur de la lave firent basculer le bras dans le fleuve de lave situait en contrebas, avant que celui-ci ne soit emporté dans une chute de lave. Kenobi et Vador eurent chacun le temps de sauter sur une plate forme de moisson flanquée d´un droid ouvrier. Leur duel continua sur divers débris charriés par le fleuve de lave, avant de finir sur le basalte noir et bouillant de la berge.

Kenobi battit Vador, le laissant pour mort. Celui-ci fut grièvement brûlé, cependant, Dark Sidious arriva à temps et accompagné de soldats clones pour le sauver.

En dépit de la nature atroce de son environnement, Mustafar avait néanmoins une vie indigène capable de survivre dans les conditions extrèmes de la planète. Le Mustafariens ne furent pas sensible au sort de la galaxie, qui se jouait sur leur planète. Ils restèrent dans leurs affaires, continuant à receuillir leur précieux minerais et l´énergie produite par les jets de lave. Ceux-ci utilisèrent pour leurs déplacements des puces de lave, capables de faire des sauts par-dessus les fleuves de magma.